3D Secure er en ekstra sikkerhedsforanstaltning, som sikrer, det rent faktisk er den kunde, der er indehaver af betalingskortet, der bruger det. Kunden får altså enten en sms med en engangskode, som skal tastes ind for at kunne komme videre. Eller bruger sit MitID som sikkerhed, samt sit brugernavn og adgangskode. Med 3D Secure version 2 bruger man nu den samme teknologi på tværs af kortbrands. Det vil sige, at både Dankort, Visa og Mastercard bruger 3D Secure version 2.